С сооружением Куйбышевской ГЭС, в 1956 г. возникла проблема изучения комплекса биологических процессов, происходящих в крупных водохранилищах. В связи с этим в 1957 г. по инициативе директора Института биологии внутренних вод АН СССР (ИБВВ АН СССР), известного полярника, дважды Героя Советского Союза, доктора географических наук Ивана Дмитриевича Папанина Президиумом АН СССР было принято решение об открытии в г.Ставрополе-на-Волге Куйбышевской биологической станции, как структурного подразделения ИБВВ АН СССР.

Ее первым директором-организатором стал кандидат биологических наук Николай Андреевич Дзюбан. В последствии руководителями биостанции были кандидаты биологических наук Сергей Михайлович Ляхов и Виктор Иванович Попченко. На живописном, высоком берегу Куйбышевского водохранилища, напротив знаменитых Жигулей, было возведено лабораторное здание, вокруг которого был разбит дендропарк.

В основу исследований биостанции был положен комплексный (фактически, экосистемный) подход к изучению водоема. Наряду с изучением микроорганизмов, фито- и зоопланктона, зообентоса и ихтиофауны, проводились гидрологические и гидрохимические исследования. Таким образом, сотрудниками биостанции были созданы все предпосылки для дальнейшего развития экологических исследований в регионе.